Irian Jaya ( Saat ini Papua ) merupakan salah satu provinsi yang menjadi tujuan utama transmigrasi. Pelaksanaan program transmigrasi di mulai sejak Prapelita sampai dengan akhir Pelita VI. Ketika itu telah ditempatkan sebanyak 237 KK transmigran ( 847 orang ) yang tersebar di 5 UPT di tiga Kabupaten Jayapura ( Dossay 57 KK/216 jiwa ), Kabupaten Nabire ( Nabaruo 11 KK/31 jiwa ) dan Kabupaten Merauke ( Kumbe 27 KK/72 jiwa, Kupri 48 KK/187 jiwa dan Kurik I 94 KK/368 jiwa ). Sampai dengan tahun 2000 jumlah transmigran yang telah ditempatkan di Provinsi Papua berjumlah sebanyak 146 UPT atau 53.853 KK/207.277 jiwa.