Berkembangnya eks permukiman transmigrasi menjadi desa-desa baru dengan pertumbuhan ekonominya yang baik, pada akhirnya berubah fungsi menjadi ibu-kota kecamatan, bahkan menjadi ibu-kota Kabupaten.
Adanya pemekaran di beberapa provinsi, seperti Provinsi Sulawesi Selatan menjadi Provinsi Sulawesi Selatan dan Provinsi Sulawesi Barat, serta Provinsi Sulawesi Utara menjadi Provinsi Sulawesi Utara dan Provinsi Gorontalo, berdampak pada beberapa desa eks permukiman transmigrasi yang semula berada di provinsi tertentu menjadi bagian dari provinsi lainnya.
Sejak Pra Pelita sampai dengan tahun 2006, jumlah permukiman transmigrasi yang sudah deserahkan kepada pemerintah daerah dan sudah menjadi desa definitif di wilayah Sulawesi sebanyak 573 desa yang tersebar di 33 kabupaten dan 1 Kota.