Informasi Permasalahan UPT merupakan peringatan dini dalam upaya meningkatkan pelaksanaan pembangunan Transmigrasi, sehingga permasalahan yang timbul di UPT dapat ditangani secara cepat dan tepat oleh unit-unit terkait, serta diharapkan dapat mencegah berkembangnya masalah di UPT tertentu ke arah yang rawan dan lebih merugi ( UPT Bermasalah ).
Pada periode bulan Juni 2004 terkumpul laporan dari 14 provinsi sejumlah 69 UPT ( 20% ) dari 347 UPT ( PTA ) pada 22 provinsi, yang memiliki UPT bina. Meskipun demikian tidak berarti bahwa 8 provinsi yang memiliki 142 UPT tidak memiliki permasalahan.
Permasalahan yang ada di UPT adalah : Penyiapan Pemukiman, Penempatan Transmigrasi, Fasilitas Pemukiman, Sarana Air Bersih, Kesehatan, Pendidikan, Transportasi, Usaha Tani Tanaman Pangan dan Usaha Tani Tanaman Perkebunan.