Informasi Permasalahan UPT merupakan sistem peringatan dini dalam upaya meningkatkan pelaksanaan pembinaan, sehingga masalah-masalah yang timbul di UPT dapat ditangani secara cepat dan tepat oleh unit-unit pelaksana terkait, serta diharapkan dapat mencegah berkembangannya masalah di UPT tertentu ke arah yang rawan dan lebih merugikan ( UPT Bermasalah ).
Pada periode bulan Oktober 2001 terdapat 76 UPT ( 16,81% ) yang melapor permasalahan UPT, Permasalahan UPT tersebut meliputi :
Penyiapan Pemukiman, Penempatan Transmigrasi, Fasilitas Pemukiman, Sarana Air Bersih, Kesehatan, Pendidikan, Usaha Tani Tanaman Pangan dan Usaha Tani Tanaman Perkebunan.