Informasi Permasalahan UPT merupakan sistem peringatan dini dalam upaya meningkatkan pembinaan, sehingga masalah-masalah yang timbul di UPT dapat ditangani secara cepat dan tepat oleh unit-unit pelaksana terkait, serta diharapkan dapat mencegah berkembangnya masalah di UPT tertentu ke arah yang rawan dan lebih merugikan ( UPT Bermasalah ).
Pada periode bulan september 2001 terdapat 68 UPT ( 14,72% ) yang melapor permasalahn UPT, dan permasalah tersebut meliputi :
Penyiapan Pemukiman, Penempatan Transmigrasi, Fasilitas Pemukiman, Sarana Air Bersih, Kesehatan, Pendidikan, Usaha Tani Tanaman Pangan, Transportasi dan Usaha Tani Perkebunan.